Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PHACTR1Q9C0D0 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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