Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
ZBED3Q96IU2 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ZBED3Q96IU2 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ZBED3Q96IU2 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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ZBED3Q96IU2 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
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