Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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RTN1Q16799 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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RTN1Q16799 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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RTN1Q16799 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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RTN1Q16799 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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RTN1Q16799 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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RTN1Q16799 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
RTN1Q16799 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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