Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
HERC1Q15751 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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