Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PDCD1Q15116 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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