Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR378C-201ENST00000578683 81 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RN7SL270P-201ENST00000579643 281 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 Metazoa_SRP.202-201ENST00000585071 281 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 NOL8-208ENST00000442668 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 ARHGEF3-214ENST00000497267 2197 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
LAPTM4AQ15012 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ATF3-201ENST00000336937 482 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AP001264.1-201ENST00000620602 703 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
LAPTM4AQ15012 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms