Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 SCOC-204ENST00000394205 1964 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 SNORD8-201ENST00000363915 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 ZBTB40-IT1-201ENST00000438551 273 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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COL19A1Q14993 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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COL19A1Q14993 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC091193.1-201ENST00000604640 448 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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COL19A1Q14993 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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COL19A1Q14993 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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COL19A1Q14993 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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COL19A1Q14993 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
COL19A1Q14993 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
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