Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SMCO1Q147U7 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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