Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
SSPNQ14714 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms