Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
EXOSC2Q13868 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms