Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
NCOA4Q13772 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
NCOA4Q13772 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms