Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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C1orf61Q13536 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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C1orf61Q13536 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
C1orf61Q13536 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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