Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ATRQ13535 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ATRQ13535 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC016590.3-201ENST00000611171 753 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
ATRQ13535 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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