Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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TOP3AQ13472 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TOP3AQ13472 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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