Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF6Q13247 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms