Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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CBX3Q13185 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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CBX3Q13185 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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