Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CHAF1BQ13112 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms