Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
GPS1Q13098 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms