Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SALL4P7-201ENST00000555779 3120 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC099062.1-202ENST00000640362 3864 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC005821.1-203ENST00000577270 3145 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ERVW-1-202ENST00000603053 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNU1-24P-201ENST00000364285 165 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 ERMARD-202ENST00000366772 2003 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
MKRN3Q13064 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 RPS10P20-201ENST00000494130 463 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
MKRN3Q13064 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
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