Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms