Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RPS29P62273 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RPS29P62273 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
RPS29P62273 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
RPS29P62273 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
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