Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
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