Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC002310.3-201ENST00000569728 723 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 FAM216B-202ENST00000537894 3300 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
TIMMDC1Q9NPL8 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158 ms