Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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CCDC90BQ9GZT6 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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CCDC90BQ9GZT6 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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CCDC90BQ9GZT6 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
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CCDC90BQ9GZT6 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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CCDC90BQ9GZT6 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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CCDC90BQ9GZT6 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
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CCDC90BQ9GZT6 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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CCDC90BQ9GZT6 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
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CCDC90BQ9GZT6 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CCDC90BQ9GZT6 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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