Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
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ARXQ96QS3 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
ARXQ96QS3 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
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