Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP2-201ENST00000496515 740 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC133435.1-201ENST00000498753 576 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC011410.1-201ENST00000524175 705 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC02301-202ENST00000555150 428 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC020914.7-201ENST00000594477 545 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 HHLA2-201ENST00000357759 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MAP9-208ENST00000515654 2044 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MED21-201ENST00000282892 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 C15orf41-214ENST00000569302 1325 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 GPX2-201ENST00000389614 990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL591368.1-202ENST00000413050 548 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL663061.1-201ENST00000416625 580 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL354761.1-201ENST00000434190 526 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC00475-206ENST00000434944 796 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 SAP18P3-201ENST00000449663 396 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 TMEM132D-AS1-204ENST00000537367 531 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC090181.1-201ENST00000560446 264 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC025280.1-201ENST00000562393 260 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ANKRD39Q53RE8 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms