Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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RTN1Q16799 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
RTN1Q16799 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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