Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TNXAQ16473 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms