Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SEMA3AQ14563 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms