Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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DDX39BQ13838 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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DDX39BQ13838 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
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DDX39BQ13838 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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DDX39BQ13838 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
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DDX39BQ13838 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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DDX39BQ13838 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
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