Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CUL4BQ13620 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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