Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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HDAC1Q13547 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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HDAC1Q13547 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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HDAC1Q13547 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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HDAC1Q13547 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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HDAC1Q13547 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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HDAC1Q13547 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC00561-201ENST00000565815 2738 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
HDAC1Q13547 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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