Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
TUBB3Q13509 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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