Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC013410.1-201ENST00000436223 1232 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
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TCOF1Q13428 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
TCOF1Q13428 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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