Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
XRCC4Q13426 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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XRCC4Q13426 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
XRCC4Q13426 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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