Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR6075-201ENST00000620782 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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NME3Q13232 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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NME3Q13232 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NME3Q13232 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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