Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHAF1AQ13111 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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