Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
STX4Q12846 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
STX4Q12846 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
STX4Q12846 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
STX4Q12846 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
STX4Q12846 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
STX4Q12846 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
STX4Q12846 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
STX4Q12846 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
STX4Q12846 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
STX4Q12846 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
STX4Q12846 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
STX4Q12846 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms