Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PTPREP23469 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 OR2A12-202ENST00000641592 4163 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AC243571.1-201ENST00000615743 478 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PTPREP23469 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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