Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC2□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.7 ms