Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
UHRF1Q96T88 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179.3 ms