Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL35AP15-201ENST00000468042 339 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CCDC142Q17RM4 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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