Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
LAMA3Q16787 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC2.57□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
LAMA3Q16787 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
LAMA3Q16787 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
LAMA3Q16787 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms