Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HIF1AQ16665 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LINC01684-203ENST00000453784 2908 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HIF1AQ16665 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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