Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
FXNQ16595 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FXNQ16595 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FXNQ16595 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FXNQ16595 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
FXNQ16595 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FXNQ16595 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
FXNQ16595 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
FXNQ16595 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms