Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HMGN3Q15651 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
HMGN3Q15651 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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