Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
DDX39BQ13838 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.34□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
DDX39BQ13838 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms