Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CDH18Q13634 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CDH18Q13634 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms