Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SP140Q13342 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SP140Q13342 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SP140Q13342 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SP140Q13342 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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SP140Q13342 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
SP140Q13342 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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