Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
RPA4Q13156 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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RPA4Q13156 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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